r语言画分布图
1、R中的画地图的方法不外乎两种，一种是利用GIS方面的数据，在R中画出来，另一种是直接从谷歌地图等地方拿来主义。
2、可以用内置的graphic包来画，就是plot()和curve()也可以用ggplot2来画，后者更灵活。
3、作为一种语言进行统计分析，R有一个随机数生成各种统计分布功能的综合性图书馆。R语言可以针对不同的分布，生成该分布下的随机数。其中有许多常用的个分布可以直接调用。
4、接下来通过该示例文件，展示使用R语言绘制差异基因表达“对称散点图”过程。首先对数据做一些预处理。
R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换
1、对于没有转换的gene ID，clusterProfiler也提供了 bitr 方法进行转换ID：可以看到，这里转换ID的对应文件来源于org.Hs.eg.db这个包。
2、)检查结果，可见geneID展示为gene symbol。（1）在enrichGO函数中，设置readable = TRUE；(2)用setReadable函数，对GO或者KEGG结果进行转化即可。
3、你可以直接导入基因号和GO/KEGG编号的对应关系到R里面，然后用clusterProfiler进行数据分析” 。在如何构建的问题上，网上也有许多文章进行了介绍。构建 OrgDb 时，需要 gene_info 和 gene2go 。
用topGO进行GO富集分析
topGO是一个半自动的GO富集包，该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法，目前支持的统计方法如下：BiocManager：install(topGO)需要R的版本为=10，但biocmanager安装需要的R版本更高，现在应该是6。
两种方法： classic， elim 函数 GenTable() 可用于分析富集最为显著的 GO term 和相对应的p值。函数 score() 可以得到 topGOresult 对象中 GO term 的p值。
具体如何做物种所有基因的背景注释，请参考前述推文《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM...》。首先，打开 TBtools GO 富集分析界面 整体如上，一共三个文件：具体示例如下 点击 Start ，随后等待即可。
r语言画go富集的介绍就聊到这里吧，感谢你花时间阅读本站内容，更多关于r语言画图legend、r语言画go富集的信息别忘了在本站进行查找喔。